药学部始建于1970年。秉承着以病人为中心的宗旨，紧随着医院改革发展的步伐，科室从建立初期只有5人的药房，发展为现有药学人员113人（其中高级职称19人，中级职称30人，具有博士2人，硕士研究生学历22人）的集药品供应管理、临床药学服务、药学教育与科研为一体并具有药品监督管理职能的医技职能部门。药学部下设临床药学科，静脉用药配置中心，药品供应调配中心等亚专科，主要负责全院药品采购供应、临床合理用药、药学科研、教学以及医院药事监督管理等任务。

药学部积极推进智慧药房信息化建设，2015年引进粤西地区首台全自动摆药机、2016年引进粤西首台全自动整盒发药机及智能药架，2019年建立湛江地区首家静脉用药调配中心，同年引进了“智慧药学平台”信息管理系统，大幅提高医院药房的工作效率和质量，实现自动化药品管理。现门诊西药房日调剂处方量最高达近7000张，中心药房保障全院3000余张床位住院患者的药品供应，静脉用药配置中心业务逐步扩大，覆盖全院17个科室（病区），完成我院绝对大部分抗肿瘤药物和部分肠外营养液的配置。2021年，开展中药（膏方）个性化用药调配，次年引进中药配方颗粒，大大提升我院了中医药服务能力。同时积极开展“以患者为中心”的临床药学工作，覆盖通科药学、抗感染药物专业、心血管内科专业、抗肿瘤药物专业、内分泌药物专业、呼吸与重症医学专业、小儿用药专业、危重医学9个专业，参与临床查房、会诊，开展临床合理用药监控，上报药品不良反应，并向临床提供药学咨询、用药教育、药学科普等。多次被广东省药品监督管理局评为“广东省药品不良反应监测工作表现突出单位”等。2022年我院获批中华医学会临床药学分会临床药师学员培训中心，为湛江市及周边地区培养高质量、高水平的临床药学人才。

2018年11月，我院药学门诊正式开诊，为市民提供个体化用药指导和建议。临床药学教研室成立十余年，承担药学研究生、本科生理论教学与实习带教工作，教学经验丰富，全体教师共同探索教学新模式、新思路，努力实现教风和教学质量双提升。药学部积极开展药学科研，先后获得省、市科技成果奖5项、立项课题20余项，为粤西地区医疗机构药师搭建交流学习平台，展现我院药学部在粤西地区较高的药学学科水平和地位。

多位药学专家担任省市级以上学术团体主任委员、副主任委员。药学部多次举办/承办粤西地区药学学术会议，为粤西地区医疗机构药师搭建交流学习的平台，展现了我院药学部在粤西地区较高的药学学科水平和地位。近年来，药学部本着以患者为中心的思想，向大众科普正确的用药知识，并斩获多个药学类科普大赛奖项。药学部承担硕士研究生、本科学生的教学工作。